Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCN9AQ15858 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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