Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHRNA2Q15822 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNA2Q15822 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms