Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRIP13Q15645 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
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