Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PDCD1Q15116 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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PDCD1Q15116 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PDCD1Q15116 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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