Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SCARF1Q14162 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SCARF1Q14162 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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