Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATMQ13315 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATMQ13315 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATMQ13315 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATMQ13315 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATMQ13315 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATMQ13315 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATMQ13315 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATMQ13315 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATMQ13315 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATMQ13315 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATMQ13315 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATMQ13315 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATMQ13315 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATMQ13315 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATMQ13315 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATMQ13315 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATMQ13315 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATMQ13315 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATMQ13315 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATMQ13315 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATMQ13315 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATMQ13315 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATMQ13315 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATMQ13315 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATMQ13315 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATMQ13315 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATMQ13315 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATMQ13315 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATMQ13315 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ATMQ13315 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATMQ13315 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATMQ13315 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATMQ13315 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATMQ13315 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATMQ13315 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATMQ13315 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATMQ13315 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATMQ13315 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATMQ13315 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATMQ13315 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATMQ13315 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATMQ13315 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATMQ13315 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATMQ13315 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATMQ13315 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms