Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIM28Q13263 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM28Q13263 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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