Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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RAB40BQ12829 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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RAB40BQ12829 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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RAB40BQ12829 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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RAB40BQ12829 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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RAB40BQ12829 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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RAB40BQ12829 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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RAB40BQ12829 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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RAB40BQ12829 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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RAB40BQ12829 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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RAB40BQ12829 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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RAB40BQ12829 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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RAB40BQ12829 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB40BQ12829 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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