Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF5Q12774 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF5Q12774 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF5Q12774 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF5Q12774 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF5Q12774 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF5Q12774 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF5Q12774 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF5Q12774 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF5Q12774 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF5Q12774 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF5Q12774 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF5Q12774 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF5Q12774 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF5Q12774 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF5Q12774 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF5Q12774 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF5Q12774 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF5Q12774 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF5Q12774 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF5Q12774 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF5Q12774 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF5Q12774 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF5Q12774 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF5Q12774 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF5Q12774 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF5Q12774 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF5Q12774 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF5Q12774 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF5Q12774 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF5Q12774 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF5Q12774 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF5Q12774 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF5Q12774 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms