Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC15Q0P6D6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms