Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PLCB3Q01970 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms