Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TFAMQ00059 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TFAMQ00059 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms