Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMF1P82094 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMF1P82094 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMF1P82094 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMF1P82094 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMF1P82094 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMF1P82094 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMF1P82094 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMF1P82094 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMF1P82094 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMF1P82094 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMF1P82094 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMF1P82094 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMF1P82094 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMF1P82094 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMF1P82094 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMF1P82094 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMF1P82094 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMF1P82094 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMF1P82094 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMF1P82094 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMF1P82094 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMF1P82094 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMF1P82094 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TMF1P82094 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMF1P82094 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMF1P82094 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TMF1P82094 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMF1P82094 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMF1P82094 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMF1P82094 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMF1P82094 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMF1P82094 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMF1P82094 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TMF1P82094 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TMF1P82094 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMF1P82094 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMF1P82094 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMF1P82094 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMF1P82094 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMF1P82094 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMF1P82094 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMF1P82094 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMF1P82094 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMF1P82094 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMF1P82094 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMF1P82094 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMF1P82094 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMF1P82094 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMF1P82094 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMF1P82094 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMF1P82094 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMF1P82094 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMF1P82094 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMF1P82094 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMF1P82094 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMF1P82094 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TMF1P82094 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMF1P82094 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TMF1P82094 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMF1P82094 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMF1P82094 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMF1P82094 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMF1P82094 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TMF1P82094 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMF1P82094 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMF1P82094 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMF1P82094 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TMF1P82094 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMF1P82094 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMF1P82094 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMF1P82094 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMF1P82094 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMF1P82094 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMF1P82094 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMF1P82094 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMF1P82094 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMF1P82094 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMF1P82094 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMF1P82094 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMF1P82094 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMF1P82094 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMF1P82094 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMF1P82094 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMF1P82094 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMF1P82094 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMF1P82094 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMF1P82094 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMF1P82094 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMF1P82094 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMF1P82094 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMF1P82094 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMF1P82094 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMF1P82094 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMF1P82094 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMF1P82094 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMF1P82094 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMF1P82094 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMF1P82094 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMF1P82094 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms