Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA3P52797 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EFNA3P52797 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms