Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TAF6P49848 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TAF6P49848 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TAF6P49848 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TAF6P49848 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms