Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CDKN1BP46527 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms