Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RANGAP1P46060 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RANGAP1P46060 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms