Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARL1P40616 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ARL1P40616 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ARL1P40616 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ARL1P40616 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ARL1P40616 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ARL1P40616 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ARL1P40616 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ARL1P40616 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ARL1P40616 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ARL1P40616 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ARL1P40616 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ARL1P40616 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ARL1P40616 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms