Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPRMP28827 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
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