Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
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