Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KB1P23443 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RPS6KB1P23443 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPS6KB1P23443 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPS6KB1P23443 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPS6KB1P23443 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPS6KB1P23443 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KB1P23443 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KB1P23443 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KB1P23443 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KB1P23443 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KB1P23443 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KB1P23443 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms