Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRHP20396 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRHP20396 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRHP20396 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRHP20396 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRHP20396 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRHP20396 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRHP20396 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRHP20396 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRHP20396 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRHP20396 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRHP20396 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRHP20396 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRHP20396 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRHP20396 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRHP20396 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRHP20396 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRHP20396 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRHP20396 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRHP20396 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRHP20396 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRHP20396 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRHP20396 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRHP20396 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRHP20396 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRHP20396 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRHP20396 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRHP20396 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRHP20396 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRHP20396 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRHP20396 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRHP20396 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRHP20396 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRHP20396 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRHP20396 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRHP20396 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRHP20396 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRHP20396 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRHP20396 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRHP20396 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRHP20396 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRHP20396 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRHP20396 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRHP20396 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRHP20396 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRHP20396 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRHP20396 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRHP20396 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRHP20396 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRHP20396 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRHP20396 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRHP20396 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRHP20396 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRHP20396 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRHP20396 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRHP20396 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRHP20396 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRHP20396 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRHP20396 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRHP20396 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRHP20396 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRHP20396 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRHP20396 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRHP20396 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRHP20396 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRHP20396 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRHP20396 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRHP20396 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRHP20396 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRHP20396 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRHP20396 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRHP20396 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRHP20396 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRHP20396 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRHP20396 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRHP20396 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRHP20396 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRHP20396 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRHP20396 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRHP20396 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRHP20396 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRHP20396 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRHP20396 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRHP20396 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRHP20396 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRHP20396 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRHP20396 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRHP20396 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRHP20396 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRHP20396 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRHP20396 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRHP20396 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRHP20396 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRHP20396 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRHP20396 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRHP20396 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRHP20396 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRHP20396 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRHP20396 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRHP20396 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
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