Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SDSP20132 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SDSP20132 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SDSP20132 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDSP20132 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDSP20132 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDSP20132 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDSP20132 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDSP20132 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDSP20132 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDSP20132 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDSP20132 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDSP20132 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SDSP20132 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDSP20132 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDSP20132 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SDSP20132 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDSP20132 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDSP20132 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SDSP20132 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SDSP20132 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDSP20132 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDSP20132 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SDSP20132 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SDSP20132 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SDSP20132 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SDSP20132 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SDSP20132 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SDSP20132 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SDSP20132 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDSP20132 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDSP20132 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDSP20132 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDSP20132 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDSP20132 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDSP20132 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDSP20132 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDSP20132 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDSP20132 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDSP20132 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDSP20132 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDSP20132 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDSP20132 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDSP20132 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDSP20132 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDSP20132 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDSP20132 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDSP20132 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDSP20132 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDSP20132 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDSP20132 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDSP20132 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDSP20132 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SDSP20132 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDSP20132 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDSP20132 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDSP20132 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDSP20132 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDSP20132 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDSP20132 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDSP20132 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SDSP20132 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SDSP20132 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms