Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms