Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms