Protein–RNA interactions for Protein: P07988

SFTPB, Pulmonary surfactant-associated protein B, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPBP07988 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPBP07988 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPBP07988 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms