Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBP07199 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBP07199 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBP07199 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBP07199 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBP07199 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBP07199 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBP07199 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBP07199 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBP07199 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBP07199 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBP07199 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBP07199 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBP07199 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBP07199 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBP07199 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBP07199 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBP07199 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBP07199 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBP07199 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBP07199 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBP07199 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBP07199 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBP07199 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPBP07199 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPBP07199 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPBP07199 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPBP07199 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPBP07199 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPBP07199 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPBP07199 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPBP07199 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPBP07199 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPBP07199 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPBP07199 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPBP07199 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPBP07199 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPBP07199 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPBP07199 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPBP07199 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPBP07199 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPBP07199 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPBP07199 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPBP07199 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPBP07199 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPBP07199 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPBP07199 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPBP07199 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPBP07199 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPBP07199 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPBP07199 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPBP07199 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPBP07199 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPBP07199 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPBP07199 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPBP07199 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPBP07199 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPBP07199 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPBP07199 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPBP07199 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPBP07199 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPBP07199 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPBP07199 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPBP07199 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPBP07199 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPBP07199 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPBP07199 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPBP07199 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPBP07199 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPBP07199 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPBP07199 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPBP07199 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPBP07199 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPBP07199 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPBP07199 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPBP07199 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPBP07199 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPBP07199 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPBP07199 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPBP07199 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPBP07199 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPBP07199 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPBP07199 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPBP07199 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPBP07199 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPBP07199 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPBP07199 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPBP07199 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPBP07199 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPBP07199 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPBP07199 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPBP07199 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPBP07199 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPBP07199 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPBP07199 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPBP07199 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPBP07199 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPBP07199 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPBP07199 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPBP07199 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms