Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD2O96028 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD2O96028 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD2O96028 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD2O96028 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD2O96028 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD2O96028 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD2O96028 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD2O96028 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD2O96028 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD2O96028 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD2O96028 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD2O96028 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD2O96028 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD2O96028 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD2O96028 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD2O96028 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD2O96028 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD2O96028 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD2O96028 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD2O96028 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD2O96028 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSD2O96028 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSD2O96028 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD2O96028 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD2O96028 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD2O96028 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD2O96028 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD2O96028 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD2O96028 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD2O96028 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD2O96028 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD2O96028 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD2O96028 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD2O96028 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD2O96028 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD2O96028 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD2O96028 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD2O96028 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD2O96028 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD2O96028 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD2O96028 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD2O96028 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSD2O96028 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD2O96028 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD2O96028 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD2O96028 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD2O96028 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD2O96028 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD2O96028 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD2O96028 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD2O96028 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD2O96028 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD2O96028 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD2O96028 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD2O96028 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD2O96028 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD2O96028 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD2O96028 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD2O96028 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD2O96028 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD2O96028 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD2O96028 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD2O96028 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD2O96028 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD2O96028 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSD2O96028 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms