Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL18O94889 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms