Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms