Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNMO15061 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNMO15061 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNMO15061 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNMO15061 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNMO15061 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNMO15061 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNMO15061 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNMO15061 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNMO15061 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNMO15061 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNMO15061 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNMO15061 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNMO15061 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNMO15061 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNMO15061 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNMO15061 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNMO15061 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNMO15061 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNMO15061 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNMO15061 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNMO15061 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNMO15061 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNMO15061 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNMO15061 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNMO15061 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNMO15061 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNMO15061 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNMO15061 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNMO15061 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNMO15061 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNMO15061 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNMO15061 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNMO15061 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNMO15061 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNMO15061 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNMO15061 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNMO15061 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNMO15061 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNMO15061 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNMO15061 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNMO15061 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNMO15061 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNMO15061 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNMO15061 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNMO15061 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNMO15061 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNMO15061 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNMO15061 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNMO15061 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNMO15061 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNMO15061 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNMO15061 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNMO15061 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNMO15061 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNMO15061 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNMO15061 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNMO15061 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNMO15061 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNMO15061 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNMO15061 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNMO15061 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNMO15061 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNMO15061 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNMO15061 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNMO15061 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNMO15061 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNMO15061 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNMO15061 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNMO15061 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNMO15061 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNMO15061 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNMO15061 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms