Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ERVH48-1M5A8F1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms