Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms