Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
FARSAQ9Y285 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FARSAQ9Y285 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms