Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERVW-1Q9UQF0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms