Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CIZ1Q9ULV3 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CIZ1Q9ULV3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CIZ1Q9ULV3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CIZ1Q9ULV3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CIZ1Q9ULV3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CIZ1Q9ULV3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CIZ1Q9ULV3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CIZ1Q9ULV3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CIZ1Q9ULV3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIZ1Q9ULV3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms