Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MED23Q9ULK4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms