Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CLN8Q9UBY8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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