Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DNAJC28Q9NX36 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms