Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ERVK-5Q9HDB9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms