Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPRHQ9HD43 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms