Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms