Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCNAQ96QF7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms