Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms