Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms