Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP54Q7Z3B4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP54Q7Z3B4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms