Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCBE1Q6UXH8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms