Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SUSD1Q6UWL2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SUSD1Q6UWL2 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms