Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDCA8Q53HL2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDCA8Q53HL2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms