Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NBPF1Q3BBV0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms